مسجد امام حسین (ع) در سال 1363 ش در زمینی به مساحت 6000 متر مربع، روبروی بیمارستان ایرانیان واقع در منطقۀ جمیرا ، خیابان الوصل ، با مساعدت هلال احمر جمهوری اسلامی ایران و شيعيان خیّر مقیم امارات و با پي گيری حجت الاسلام و المسلمين برقعی نماینده وقت حضرت امام خمینی (ره) در امارات بنا گردید و طی سالهای بعد با پی گیری نمایندگان مقام معظم رهبری ، حضرت آیت الله العظمی خامنه ای در امارات ،  تکمیل و تو سعه داده شد . مجموع ابنيه مسجد 2500 متر مربع است که شامل صحن مسجد (4 سالن)، بخش اداری، کتابخانه، محل عرضه محصولات فرهنگی، آموزشگاه، مهد کودک، مهمان سرا، دو واحد مسکونی، آشپزخانه ، سرویس بهداشتی و ... می‌باشد.

پس از حجت الاسلام و المسلمین برقعی، حجت الاسلام و المسلمین مروی حکیم و سپس حجت الاسلام و المسلمین اکبریان به عنوان نمایندگان رهبری تا سال 1378 در مسجد امام حسین (ع) اقامه جمعه و جماعت کردند .

در سال 1378 مقام معظم رهبری ، حجت الاسلام و المسلمین سید علی شاهچراغی را به عنوان نماینده خویش در امارات و امام جمعه مسجد امام حسین (ع) منصوب کردند که تا کنون عهده دار این مسئولیت‌ می‌باشند.

در مسجد امام حسین با اشراف و مدیریت نماینده مقام معظم رهبری فعالیتهای گوناگون دینی ، فرهنگی و اجتماعی برگزار
 می شود که با مراجعه به بخشهای مختلف این پایگاه می توانید با آنها آشنا شوید .